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GENOSCREEN

Ingénieur en BioInformatique (H/F)

Ville

  • 59000 Lille

Contrat

  • CDI

Métier

  • Informatique / Numérique

Présentation de l'entreprise

Société de Services et d’Innovation en génomique et en bio-informatique - Nous proposons une large palette de prestations de services en biologie moléculaire pour divers secteurs d’activité (Santé, Environnement, Agriculture, Agroalimentaire, etc.). Nous développons également et commercialisons des solutions logicielles associées à des kits de diagnostic pour le secteur de la Santé.

Description du poste

- Vous prendrez part aux prestations bioinformatiques de la société et à leur développement

- Vous contribuerez au développement d’outils d’analyse et d’applications bioinformatiques

- Vous interviendrez dans les sessions de formation à la bioinformatique proposées par la société

Profil recherché

Compétences requises :

- Une excellente connaissance des environnements Windows et Linux.

- La maîtrise d’au moins un langage de script (Python/R…)

- Une bonne maîtrise des données issues des technologies de séquençage Illumina/Pacific Bioscience/Oxford Nanopore

- Une bonne connaissance des différentes analyses génomique et des outils associés à leur réalisation (assemblage de génome, annotation, métagénomique, etc.)

- Une expérience en développement de pipelines d’analyse (SnakeMake et/ou NextFlow)

Compétences additionnelles qui seraient un plus :

- Une bonne connaissance d’un gestionnaire de conteneurs (Docker).

- Des connaissances en visualisation de données (ggplot/D3.js), en bio-statistiques et/ou en approches Machine Learning

- Des capacités en création d’interfaces graphiques/applications (Django/Shiny/React, etc.)

- Une aptitude au langage base de données type SQL et suivi développement SVN

- Des connaissances en informatique et en gestion de réseaux

Cadre

Non

Fourchette de salaire

Selon diplôme et expérience

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